Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mbd3Q9Z2D8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mbd3Q9Z2D8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Mbd3Q9Z2D8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mbd3Q9Z2D8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mbd3Q9Z2D8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mbd3Q9Z2D8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mbd3Q9Z2D8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Mbd3Q9Z2D8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mbd3Q9Z2D8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mbd3Q9Z2D8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mbd3Q9Z2D8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mbd3Q9Z2D8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mbd3Q9Z2D8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mbd3Q9Z2D8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mbd3Q9Z2D8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Mbd3Q9Z2D8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Mbd3Q9Z2D8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mbd3Q9Z2D8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mbd3Q9Z2D8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mbd3Q9Z2D8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mbd3Q9Z2D8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Mbd3Q9Z2D8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mbd3Q9Z2D8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mbd3Q9Z2D8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mbd3Q9Z2D8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Mbd3Q9Z2D8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mbd3Q9Z2D8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mbd3Q9Z2D8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mbd3Q9Z2D8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mbd3Q9Z2D8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mbd3Q9Z2D8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mbd3Q9Z2D8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mbd3Q9Z2D8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mbd3Q9Z2D8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mbd3Q9Z2D8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mbd3Q9Z2D8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mbd3Q9Z2D8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mbd3Q9Z2D8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mbd3Q9Z2D8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mbd3Q9Z2D8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mbd3Q9Z2D8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mbd3Q9Z2D8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mbd3Q9Z2D8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms