Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVQ0

Pmfbp1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pmfbp1Q9WVQ0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms