Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV89

Stxbp4, Syntaxin-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp4Q9WV89 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Stxbp4Q9WV89 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stxbp4Q9WV89 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stxbp4Q9WV89 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stxbp4Q9WV89 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stxbp4Q9WV89 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stxbp4Q9WV89 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stxbp4Q9WV89 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stxbp4Q9WV89 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stxbp4Q9WV89 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stxbp4Q9WV89 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stxbp4Q9WV89 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stxbp4Q9WV89 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stxbp4Q9WV89 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stxbp4Q9WV89 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stxbp4Q9WV89 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stxbp4Q9WV89 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stxbp4Q9WV89 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stxbp4Q9WV89 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stxbp4Q9WV89 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stxbp4Q9WV89 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stxbp4Q9WV89 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stxbp4Q9WV89 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stxbp4Q9WV89 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Stxbp4Q9WV89 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Stxbp4Q9WV89 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Stxbp4Q9WV89 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stxbp4Q9WV89 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stxbp4Q9WV89 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stxbp4Q9WV89 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stxbp4Q9WV89 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stxbp4Q9WV89 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stxbp4Q9WV89 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stxbp4Q9WV89 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stxbp4Q9WV89 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stxbp4Q9WV89 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stxbp4Q9WV89 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stxbp4Q9WV89 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Stxbp4Q9WV89 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stxbp4Q9WV89 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stxbp4Q9WV89 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Stxbp4Q9WV89 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stxbp4Q9WV89 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stxbp4Q9WV89 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stxbp4Q9WV89 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stxbp4Q9WV89 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stxbp4Q9WV89 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stxbp4Q9WV89 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stxbp4Q9WV89 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stxbp4Q9WV89 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stxbp4Q9WV89 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stxbp4Q9WV89 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stxbp4Q9WV89 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stxbp4Q9WV89 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stxbp4Q9WV89 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stxbp4Q9WV89 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms