Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV55

Vapa, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapaQ9WV55 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
VapaQ9WV55 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VapaQ9WV55 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VapaQ9WV55 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VapaQ9WV55 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VapaQ9WV55 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VapaQ9WV55 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VapaQ9WV55 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VapaQ9WV55 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VapaQ9WV55 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VapaQ9WV55 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VapaQ9WV55 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VapaQ9WV55 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VapaQ9WV55 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VapaQ9WV55 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VapaQ9WV55 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
VapaQ9WV55 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VapaQ9WV55 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VapaQ9WV55 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VapaQ9WV55 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VapaQ9WV55 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
VapaQ9WV55 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VapaQ9WV55 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VapaQ9WV55 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VapaQ9WV55 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VapaQ9WV55 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VapaQ9WV55 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VapaQ9WV55 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms