Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PplQ9R269 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PplQ9R269 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PplQ9R269 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PplQ9R269 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PplQ9R269 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PplQ9R269 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PplQ9R269 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PplQ9R269 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PplQ9R269 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PplQ9R269 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PplQ9R269 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PplQ9R269 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PplQ9R269 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PplQ9R269 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PplQ9R269 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PplQ9R269 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PplQ9R269 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PplQ9R269 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PplQ9R269 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PplQ9R269 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PplQ9R269 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PplQ9R269 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PplQ9R269 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PplQ9R269 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PplQ9R269 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PplQ9R269 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PplQ9R269 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PplQ9R269 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PplQ9R269 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PplQ9R269 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PplQ9R269 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PplQ9R269 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PplQ9R269 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PplQ9R269 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PplQ9R269 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PplQ9R269 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PplQ9R269 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PplQ9R269 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PplQ9R269 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PplQ9R269 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PplQ9R269 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PplQ9R269 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PplQ9R269 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PplQ9R269 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PplQ9R269 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PplQ9R269 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PplQ9R269 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PplQ9R269 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PplQ9R269 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PplQ9R269 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PplQ9R269 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PplQ9R269 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PplQ9R269 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PplQ9R269 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PplQ9R269 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PplQ9R269 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PplQ9R269 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PplQ9R269 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PplQ9R269 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PplQ9R269 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PplQ9R269 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PplQ9R269 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PplQ9R269 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PplQ9R269 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PplQ9R269 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PplQ9R269 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PplQ9R269 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PplQ9R269 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PplQ9R269 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PplQ9R269 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PplQ9R269 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PplQ9R269 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PplQ9R269 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PplQ9R269 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PplQ9R269 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PplQ9R269 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PplQ9R269 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PplQ9R269 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PplQ9R269 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PplQ9R269 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PplQ9R269 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PplQ9R269 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PplQ9R269 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PplQ9R269 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PplQ9R269 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PplQ9R269 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PplQ9R269 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PplQ9R269 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PplQ9R269 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PplQ9R269 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PplQ9R269 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PplQ9R269 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PplQ9R269 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PplQ9R269 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PplQ9R269 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PplQ9R269 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PplQ9R269 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PplQ9R269 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PplQ9R269 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms