Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms