Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms