Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Lamc3Q9R0B6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Lamc3Q9R0B6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Lamc3Q9R0B6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Lamc3Q9R0B6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Lamc3Q9R0B6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Lamc3Q9R0B6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Lamc3Q9R0B6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Lamc3Q9R0B6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Lamc3Q9R0B6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Lamc3Q9R0B6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Lamc3Q9R0B6 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lamc3Q9R0B6 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Lamc3Q9R0B6 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lamc3Q9R0B6 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Lamc3Q9R0B6 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Lamc3Q9R0B6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lamc3Q9R0B6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lamc3Q9R0B6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lamc3Q9R0B6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lamc3Q9R0B6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lamc3Q9R0B6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lamc3Q9R0B6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Lamc3Q9R0B6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Lamc3Q9R0B6 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Lamc3Q9R0B6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Lamc3Q9R0B6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Lamc3Q9R0B6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Lamc3Q9R0B6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Lamc3Q9R0B6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Lamc3Q9R0B6 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Lamc3Q9R0B6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Lamc3Q9R0B6 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Lamc3Q9R0B6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Lamc3Q9R0B6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Lamc3Q9R0B6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Lamc3Q9R0B6 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Lamc3Q9R0B6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Lamc3Q9R0B6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Lamc3Q9R0B6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Lamc3Q9R0B6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Lamc3Q9R0B6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Lamc3Q9R0B6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Lamc3Q9R0B6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Lamc3Q9R0B6 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Lamc3Q9R0B6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Lamc3Q9R0B6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Lamc3Q9R0B6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Lamc3Q9R0B6 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Lamc3Q9R0B6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Lamc3Q9R0B6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Lamc3Q9R0B6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Lamc3Q9R0B6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Lamc3Q9R0B6 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Lamc3Q9R0B6 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Lamc3Q9R0B6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Lamc3Q9R0B6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Lamc3Q9R0B6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Lamc3Q9R0B6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Lamc3Q9R0B6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Lamc3Q9R0B6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Lamc3Q9R0B6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Lamc3Q9R0B6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Lamc3Q9R0B6 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Lamc3Q9R0B6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Lamc3Q9R0B6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Lamc3Q9R0B6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Lamc3Q9R0B6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Lamc3Q9R0B6 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Lamc3Q9R0B6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Lamc3Q9R0B6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Lamc3Q9R0B6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Lamc3Q9R0B6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Lamc3Q9R0B6 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Lamc3Q9R0B6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Lamc3Q9R0B6 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Lamc3Q9R0B6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Lamc3Q9R0B6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Lamc3Q9R0B6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Lamc3Q9R0B6 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Lamc3Q9R0B6 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Lamc3Q9R0B6 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Lamc3Q9R0B6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Lamc3Q9R0B6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Lamc3Q9R0B6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Lamc3Q9R0B6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Lamc3Q9R0B6 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Lamc3Q9R0B6 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Lamc3Q9R0B6 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Lamc3Q9R0B6 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Lamc3Q9R0B6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Lamc3Q9R0B6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Lamc3Q9R0B6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Lamc3Q9R0B6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Lamc3Q9R0B6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Lamc3Q9R0B6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Lamc3Q9R0B6 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Lamc3Q9R0B6 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Lamc3Q9R0B6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Lamc3Q9R0B6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms