Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms