Protein–RNA interactions for Protein: Q9R014

Ctsj, Cathepsin J, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsjQ9R014 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtsjQ9R014 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtsjQ9R014 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtsjQ9R014 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtsjQ9R014 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtsjQ9R014 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtsjQ9R014 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtsjQ9R014 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtsjQ9R014 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtsjQ9R014 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtsjQ9R014 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtsjQ9R014 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtsjQ9R014 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtsjQ9R014 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtsjQ9R014 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtsjQ9R014 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtsjQ9R014 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CtsjQ9R014 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtsjQ9R014 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtsjQ9R014 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtsjQ9R014 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtsjQ9R014 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtsjQ9R014 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtsjQ9R014 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtsjQ9R014 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtsjQ9R014 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtsjQ9R014 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtsjQ9R014 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtsjQ9R014 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CtsjQ9R014 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtsjQ9R014 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtsjQ9R014 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CtsjQ9R014 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtsjQ9R014 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtsjQ9R014 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtsjQ9R014 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtsjQ9R014 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtsjQ9R014 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtsjQ9R014 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtsjQ9R014 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtsjQ9R014 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtsjQ9R014 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtsjQ9R014 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtsjQ9R014 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtsjQ9R014 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtsjQ9R014 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtsjQ9R014 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtsjQ9R014 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtsjQ9R014 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtsjQ9R014 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtsjQ9R014 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CtsjQ9R014 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtsjQ9R014 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtsjQ9R014 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtsjQ9R014 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtsjQ9R014 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtsjQ9R014 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtsjQ9R014 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtsjQ9R014 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtsjQ9R014 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CtsjQ9R014 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtsjQ9R014 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms