Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf4Q9QZS2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf4Q9QZS2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms