Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms