Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD5

Chml, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmlQ9QZD5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms