Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rdh11Q9QYF1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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