Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms