Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tcea2Q9QVN7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms