Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cln8Q9QUK3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms