Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sfmbt1Q9JMD1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms