Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMC3

Dnaja4, DnaJ homolog subfamily A member 4, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaja4Q9JMC3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnaja4Q9JMC3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.9 ms