Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

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Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Tgm1Q9JLF6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Tgm1Q9JLF6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Tgm1Q9JLF6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tgm1Q9JLF6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Tgm1Q9JLF6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Tgm1Q9JLF6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Tgm1Q9JLF6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tgm1Q9JLF6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Tgm1Q9JLF6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tgm1Q9JLF6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tgm1Q9JLF6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tgm1Q9JLF6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tgm1Q9JLF6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tgm1Q9JLF6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tgm1Q9JLF6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tgm1Q9JLF6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tgm1Q9JLF6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tgm1Q9JLF6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tgm1Q9JLF6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tgm1Q9JLF6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Tgm1Q9JLF6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tgm1Q9JLF6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tgm1Q9JLF6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms