Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL70

Fanca, Fanconi anemia group A protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancaQ9JL70 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FancaQ9JL70 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FancaQ9JL70 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FancaQ9JL70 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FancaQ9JL70 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FancaQ9JL70 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FancaQ9JL70 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FancaQ9JL70 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FancaQ9JL70 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FancaQ9JL70 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FancaQ9JL70 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FancaQ9JL70 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FancaQ9JL70 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FancaQ9JL70 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FancaQ9JL70 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FancaQ9JL70 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FancaQ9JL70 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FancaQ9JL70 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FancaQ9JL70 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FancaQ9JL70 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FancaQ9JL70 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FancaQ9JL70 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FancaQ9JL70 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FancaQ9JL70 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FancaQ9JL70 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FancaQ9JL70 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FancaQ9JL70 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FancaQ9JL70 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FancaQ9JL70 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FancaQ9JL70 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FancaQ9JL70 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FancaQ9JL70 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FancaQ9JL70 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FancaQ9JL70 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FancaQ9JL70 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FancaQ9JL70 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FancaQ9JL70 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FancaQ9JL70 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FancaQ9JL70 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FancaQ9JL70 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FancaQ9JL70 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FancaQ9JL70 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FancaQ9JL70 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
FancaQ9JL70 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FancaQ9JL70 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FancaQ9JL70 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FancaQ9JL70 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FancaQ9JL70 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FancaQ9JL70 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FancaQ9JL70 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FancaQ9JL70 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FancaQ9JL70 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FancaQ9JL70 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FancaQ9JL70 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FancaQ9JL70 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FancaQ9JL70 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FancaQ9JL70 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FancaQ9JL70 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FancaQ9JL70 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FancaQ9JL70 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FancaQ9JL70 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FancaQ9JL70 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FancaQ9JL70 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FancaQ9JL70 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FancaQ9JL70 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FancaQ9JL70 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FancaQ9JL70 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FancaQ9JL70 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FancaQ9JL70 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FancaQ9JL70 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FancaQ9JL70 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FancaQ9JL70 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FancaQ9JL70 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FancaQ9JL70 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FancaQ9JL70 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FancaQ9JL70 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FancaQ9JL70 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FancaQ9JL70 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FancaQ9JL70 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FancaQ9JL70 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FancaQ9JL70 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FancaQ9JL70 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FancaQ9JL70 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FancaQ9JL70 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FancaQ9JL70 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FancaQ9JL70 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FancaQ9JL70 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FancaQ9JL70 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FancaQ9JL70 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FancaQ9JL70 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FancaQ9JL70 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FancaQ9JL70 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FancaQ9JL70 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FancaQ9JL70 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FancaQ9JL70 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FancaQ9JL70 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FancaQ9JL70 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FancaQ9JL70 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FancaQ9JL70 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FancaQ9JL70 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms