Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gde1Q9JL56 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Gde1Q9JL56 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms