Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nova1Q9JKN6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms