Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE1

Trem3, TREM-3, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem3Q9JKE1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trem3Q9JKE1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms