Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY4

Ddx20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx20Q9JJY4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ddx20Q9JJY4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ddx20Q9JJY4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ddx20Q9JJY4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ddx20Q9JJY4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ddx20Q9JJY4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ddx20Q9JJY4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ddx20Q9JJY4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ddx20Q9JJY4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ddx20Q9JJY4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ddx20Q9JJY4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ddx20Q9JJY4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ddx20Q9JJY4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ddx20Q9JJY4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ddx20Q9JJY4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ddx20Q9JJY4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ddx20Q9JJY4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ddx20Q9JJY4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ddx20Q9JJY4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ddx20Q9JJY4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ddx20Q9JJY4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ddx20Q9JJY4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ddx20Q9JJY4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ddx20Q9JJY4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ddx20Q9JJY4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ddx20Q9JJY4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ddx20Q9JJY4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ddx20Q9JJY4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms