Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG4

Ppp1r3f, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3F, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r3fQ9JIG4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ppp1r3fQ9JIG4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp1r3fQ9JIG4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp1r3fQ9JIG4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp1r3fQ9JIG4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp1r3fQ9JIG4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp1r3fQ9JIG4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp1r3fQ9JIG4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp1r3fQ9JIG4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp1r3fQ9JIG4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp1r3fQ9JIG4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp1r3fQ9JIG4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp1r3fQ9JIG4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp1r3fQ9JIG4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp1r3fQ9JIG4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp1r3fQ9JIG4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp1r3fQ9JIG4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp1r3fQ9JIG4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp1r3fQ9JIG4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp1r3fQ9JIG4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp1r3fQ9JIG4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp1r3fQ9JIG4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp1r3fQ9JIG4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp1r3fQ9JIG4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms