Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Rb1cc1Q9ESK9 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Rb1cc1Q9ESK9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Rb1cc1Q9ESK9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Rb1cc1Q9ESK9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Rb1cc1Q9ESK9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Rb1cc1Q9ESK9 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Rb1cc1Q9ESK9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
Rb1cc1Q9ESK9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Rb1cc1Q9ESK9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Rb1cc1Q9ESK9 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Rb1cc1Q9ESK9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
Rb1cc1Q9ESK9 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Rb1cc1Q9ESK9 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Rb1cc1Q9ESK9 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
Rb1cc1Q9ESK9 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Rb1cc1Q9ESK9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Rb1cc1Q9ESK9 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Rb1cc1Q9ESK9 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Rb1cc1Q9ESK9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Rb1cc1Q9ESK9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Rb1cc1Q9ESK9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Rb1cc1Q9ESK9 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
Rb1cc1Q9ESK9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Rb1cc1Q9ESK9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Rb1cc1Q9ESK9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Rb1cc1Q9ESK9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Rb1cc1Q9ESK9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Rb1cc1Q9ESK9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Rb1cc1Q9ESK9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Rb1cc1Q9ESK9 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Rb1cc1Q9ESK9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
Rb1cc1Q9ESK9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Rb1cc1Q9ESK9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Rb1cc1Q9ESK9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Rb1cc1Q9ESK9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Rb1cc1Q9ESK9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Rb1cc1Q9ESK9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Rb1cc1Q9ESK9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Rb1cc1Q9ESK9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Rb1cc1Q9ESK9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Rb1cc1Q9ESK9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Rb1cc1Q9ESK9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Rb1cc1Q9ESK9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Rb1cc1Q9ESK9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Rb1cc1Q9ESK9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Rb1cc1Q9ESK9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Rb1cc1Q9ESK9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Rb1cc1Q9ESK9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Rb1cc1Q9ESK9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Rb1cc1Q9ESK9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Rb1cc1Q9ESK9 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Rb1cc1Q9ESK9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Rb1cc1Q9ESK9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Rb1cc1Q9ESK9 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Rb1cc1Q9ESK9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Rb1cc1Q9ESK9 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Rb1cc1Q9ESK9 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Rb1cc1Q9ESK9 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Rb1cc1Q9ESK9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Rb1cc1Q9ESK9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Rb1cc1Q9ESK9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Rb1cc1Q9ESK9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Rb1cc1Q9ESK9 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Rb1cc1Q9ESK9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Rb1cc1Q9ESK9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Rb1cc1Q9ESK9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Rb1cc1Q9ESK9 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Rb1cc1Q9ESK9 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Rb1cc1Q9ESK9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Rb1cc1Q9ESK9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Rb1cc1Q9ESK9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Rb1cc1Q9ESK9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Rb1cc1Q9ESK9 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Rb1cc1Q9ESK9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Rb1cc1Q9ESK9 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Rb1cc1Q9ESK9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Rb1cc1Q9ESK9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Rb1cc1Q9ESK9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Rb1cc1Q9ESK9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Rb1cc1Q9ESK9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Rb1cc1Q9ESK9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Rb1cc1Q9ESK9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Rb1cc1Q9ESK9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Rb1cc1Q9ESK9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Rb1cc1Q9ESK9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Rb1cc1Q9ESK9 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Rb1cc1Q9ESK9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Rb1cc1Q9ESK9 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Rb1cc1Q9ESK9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Rb1cc1Q9ESK9 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
Rb1cc1Q9ESK9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms