Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA6

Tfip11, Tuftelin-interacting protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfip11Q9ERA6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms