Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tfcp2Q9ERA0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tfcp2Q9ERA0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tfcp2Q9ERA0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tfcp2Q9ERA0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tfcp2Q9ERA0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tfcp2Q9ERA0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tfcp2Q9ERA0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tfcp2Q9ERA0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tfcp2Q9ERA0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tfcp2Q9ERA0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tfcp2Q9ERA0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tfcp2Q9ERA0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tfcp2Q9ERA0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tfcp2Q9ERA0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tfcp2Q9ERA0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tfcp2Q9ERA0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tfcp2Q9ERA0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tfcp2Q9ERA0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tfcp2Q9ERA0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tfcp2Q9ERA0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tfcp2Q9ERA0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tfcp2Q9ERA0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tfcp2Q9ERA0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tfcp2Q9ERA0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tfcp2Q9ERA0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tfcp2Q9ERA0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tfcp2Q9ERA0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tfcp2Q9ERA0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tfcp2Q9ERA0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tfcp2Q9ERA0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tfcp2Q9ERA0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tfcp2Q9ERA0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tfcp2Q9ERA0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tfcp2Q9ERA0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tfcp2Q9ERA0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tfcp2Q9ERA0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tfcp2Q9ERA0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tfcp2Q9ERA0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tfcp2Q9ERA0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tfcp2Q9ERA0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tfcp2Q9ERA0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tfcp2Q9ERA0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tfcp2Q9ERA0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tfcp2Q9ERA0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tfcp2Q9ERA0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tfcp2Q9ERA0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tfcp2Q9ERA0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tfcp2Q9ERA0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tfcp2Q9ERA0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tfcp2Q9ERA0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tfcp2Q9ERA0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tfcp2Q9ERA0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tfcp2Q9ERA0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tfcp2Q9ERA0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tfcp2Q9ERA0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms