Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH7

Ndst3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst3Q9EQH7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndst3Q9EQH7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndst3Q9EQH7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndst3Q9EQH7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndst3Q9EQH7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndst3Q9EQH7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndst3Q9EQH7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndst3Q9EQH7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndst3Q9EQH7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndst3Q9EQH7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndst3Q9EQH7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndst3Q9EQH7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndst3Q9EQH7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndst3Q9EQH7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndst3Q9EQH7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndst3Q9EQH7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndst3Q9EQH7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndst3Q9EQH7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndst3Q9EQH7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndst3Q9EQH7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndst3Q9EQH7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndst3Q9EQH7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndst3Q9EQH7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndst3Q9EQH7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndst3Q9EQH7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndst3Q9EQH7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndst3Q9EQH7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndst3Q9EQH7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndst3Q9EQH7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndst3Q9EQH7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndst3Q9EQH7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndst3Q9EQH7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndst3Q9EQH7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndst3Q9EQH7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndst3Q9EQH7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndst3Q9EQH7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndst3Q9EQH7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndst3Q9EQH7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndst3Q9EQH7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndst3Q9EQH7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndst3Q9EQH7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndst3Q9EQH7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndst3Q9EQH7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndst3Q9EQH7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndst3Q9EQH7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndst3Q9EQH7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndst3Q9EQH7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndst3Q9EQH7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndst3Q9EQH7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndst3Q9EQH7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndst3Q9EQH7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndst3Q9EQH7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndst3Q9EQH7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndst3Q9EQH7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndst3Q9EQH7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms