Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms