Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC16

Ergic1, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic1Q9DC16 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ergic1Q9DC16 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ergic1Q9DC16 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ergic1Q9DC16 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ergic1Q9DC16 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ergic1Q9DC16 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ergic1Q9DC16 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ergic1Q9DC16 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ergic1Q9DC16 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ergic1Q9DC16 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ergic1Q9DC16 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ergic1Q9DC16 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ergic1Q9DC16 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ergic1Q9DC16 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ergic1Q9DC16 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ergic1Q9DC16 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ergic1Q9DC16 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ergic1Q9DC16 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ergic1Q9DC16 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ergic1Q9DC16 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ergic1Q9DC16 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ergic1Q9DC16 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ergic1Q9DC16 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ergic1Q9DC16 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ergic1Q9DC16 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ergic1Q9DC16 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ergic1Q9DC16 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ergic1Q9DC16 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ergic1Q9DC16 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ergic1Q9DC16 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ergic1Q9DC16 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ergic1Q9DC16 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ergic1Q9DC16 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ergic1Q9DC16 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ergic1Q9DC16 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ergic1Q9DC16 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ergic1Q9DC16 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ergic1Q9DC16 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ergic1Q9DC16 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ergic1Q9DC16 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ergic1Q9DC16 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ergic1Q9DC16 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ergic1Q9DC16 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ergic1Q9DC16 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ergic1Q9DC16 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ergic1Q9DC16 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ergic1Q9DC16 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ergic1Q9DC16 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ergic1Q9DC16 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ergic1Q9DC16 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ergic1Q9DC16 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ergic1Q9DC16 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ergic1Q9DC16 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ergic1Q9DC16 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ergic1Q9DC16 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ergic1Q9DC16 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ergic1Q9DC16 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ergic1Q9DC16 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ergic1Q9DC16 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ergic1Q9DC16 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ergic1Q9DC16 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ergic1Q9DC16 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ergic1Q9DC16 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ergic1Q9DC16 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ergic1Q9DC16 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ergic1Q9DC16 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ergic1Q9DC16 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ergic1Q9DC16 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ergic1Q9DC16 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ergic1Q9DC16 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ergic1Q9DC16 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ergic1Q9DC16 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ergic1Q9DC16 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ergic1Q9DC16 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ergic1Q9DC16 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ergic1Q9DC16 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ergic1Q9DC16 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ergic1Q9DC16 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ergic1Q9DC16 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ergic1Q9DC16 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ergic1Q9DC16 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ergic1Q9DC16 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ergic1Q9DC16 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ergic1Q9DC16 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ergic1Q9DC16 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ergic1Q9DC16 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ergic1Q9DC16 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ergic1Q9DC16 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ergic1Q9DC16 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ergic1Q9DC16 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ergic1Q9DC16 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ergic1Q9DC16 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ergic1Q9DC16 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ergic1Q9DC16 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ergic1Q9DC16 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ergic1Q9DC16 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ergic1Q9DC16 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ergic1Q9DC16 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ergic1Q9DC16 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ergic1Q9DC16 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms