Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms