Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY0

Foxp4, Forkhead box protein P4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp4Q9DBY0 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Foxp4Q9DBY0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Foxp4Q9DBY0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Foxp4Q9DBY0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Foxp4Q9DBY0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Foxp4Q9DBY0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Foxp4Q9DBY0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Foxp4Q9DBY0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms