Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms