Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC7

Prkar1a, cAMP-dependent protein kinase type I-alpha regulatory subunit, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkar1aQ9DBC7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkar1aQ9DBC7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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