Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smg9Q9DB90 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms