Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Med27Q9DB40 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med27Q9DB40 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms