Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL0

Smim23, Small integral membrane protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim23Q9DAL0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms