Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAE8

UPF0739 protein C1orf74 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DAE8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9DAE8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9DAE8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9DAE8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9DAE8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9DAE8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9DAE8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9DAE8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9DAE8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9DAE8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9DAE8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9DAE8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9DAE8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9DAE8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9DAE8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9DAE8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9DAE8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9DAE8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9DAE8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9DAE8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9DAE8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9DAE8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9DAE8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9DAE8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9DAE8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9DAE8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9DAE8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9DAE8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9DAE8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9DAE8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9DAE8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9DAE8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9DAE8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9DAE8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9DAE8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9DAE8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9DAE8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9DAE8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9DAE8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9DAE8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9DAE8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9DAE8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9DAE8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9DAE8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9DAE8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9DAE8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9DAE8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9DAE8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9DAE8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9DAE8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9DAE8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9DAE8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9DAE8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9DAE8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q9DAE8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9DAE8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9DAE8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9DAE8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q9DAE8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9DAE8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9DAE8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9DAE8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9DAE8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9DAE8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9DAE8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9DAE8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9DAE8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9DAE8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9DAE8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9DAE8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9DAE8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9DAE8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9DAE8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9DAE8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9DAE8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q9DAE8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9DAE8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9DAE8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9DAE8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9DAE8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9DAE8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9DAE8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9DAE8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9DAE8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9DAE8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9DAE8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9DAE8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9DAE8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9DAE8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9DAE8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9DAE8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9DAE8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9DAE8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9DAE8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9DAE8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9DAE8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9DAE8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9DAE8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9DAE8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Q9DAE8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms