Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc89Q9DA73 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms