Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA39

Tmbim4, Protein lifeguard 4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmbim4Q9DA39 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tmbim4Q9DA39 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmbim4Q9DA39 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmbim4Q9DA39 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmbim4Q9DA39 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmbim4Q9DA39 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmbim4Q9DA39 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmbim4Q9DA39 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms