Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA37

Samd8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd8Q9DA37 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd8Q9DA37 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms