Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn34b2Q9D9N2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn34b2Q9D9N2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms