Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms