Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms