Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capns2Q9D7J7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms