Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gbe1Q9D6Y9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms