Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc94Q9D6J3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc94Q9D6J3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc94Q9D6J3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc94Q9D6J3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc94Q9D6J3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc94Q9D6J3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc94Q9D6J3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc94Q9D6J3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc94Q9D6J3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc94Q9D6J3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc94Q9D6J3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc94Q9D6J3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc94Q9D6J3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc94Q9D6J3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc94Q9D6J3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc94Q9D6J3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc94Q9D6J3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc94Q9D6J3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc94Q9D6J3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc94Q9D6J3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc94Q9D6J3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc94Q9D6J3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc94Q9D6J3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc94Q9D6J3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc94Q9D6J3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc94Q9D6J3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc94Q9D6J3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc94Q9D6J3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc94Q9D6J3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc94Q9D6J3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc94Q9D6J3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc94Q9D6J3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc94Q9D6J3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc94Q9D6J3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc94Q9D6J3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc94Q9D6J3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc94Q9D6J3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc94Q9D6J3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc94Q9D6J3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc94Q9D6J3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc94Q9D6J3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc94Q9D6J3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc94Q9D6J3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc94Q9D6J3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc94Q9D6J3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc94Q9D6J3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc94Q9D6J3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc94Q9D6J3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc94Q9D6J3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc94Q9D6J3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc94Q9D6J3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc94Q9D6J3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc94Q9D6J3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc94Q9D6J3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc94Q9D6J3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc94Q9D6J3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc94Q9D6J3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc94Q9D6J3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc94Q9D6J3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc94Q9D6J3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc94Q9D6J3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc94Q9D6J3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc94Q9D6J3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc94Q9D6J3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc94Q9D6J3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc94Q9D6J3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc94Q9D6J3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc94Q9D6J3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc94Q9D6J3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc94Q9D6J3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc94Q9D6J3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc94Q9D6J3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc94Q9D6J3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc94Q9D6J3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc94Q9D6J3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms