Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab11fip1Q9D620 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab11fip1Q9D620 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab11fip1Q9D620 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab11fip1Q9D620 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab11fip1Q9D620 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab11fip1Q9D620 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab11fip1Q9D620 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab11fip1Q9D620 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab11fip1Q9D620 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab11fip1Q9D620 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab11fip1Q9D620 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab11fip1Q9D620 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab11fip1Q9D620 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab11fip1Q9D620 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rab11fip1Q9D620 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rab11fip1Q9D620 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rab11fip1Q9D620 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rab11fip1Q9D620 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab11fip1Q9D620 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab11fip1Q9D620 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab11fip1Q9D620 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab11fip1Q9D620 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab11fip1Q9D620 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab11fip1Q9D620 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab11fip1Q9D620 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab11fip1Q9D620 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab11fip1Q9D620 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab11fip1Q9D620 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab11fip1Q9D620 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab11fip1Q9D620 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab11fip1Q9D620 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab11fip1Q9D620 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab11fip1Q9D620 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab11fip1Q9D620 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab11fip1Q9D620 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab11fip1Q9D620 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab11fip1Q9D620 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab11fip1Q9D620 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab11fip1Q9D620 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab11fip1Q9D620 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab11fip1Q9D620 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab11fip1Q9D620 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab11fip1Q9D620 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab11fip1Q9D620 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab11fip1Q9D620 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab11fip1Q9D620 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab11fip1Q9D620 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab11fip1Q9D620 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab11fip1Q9D620 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab11fip1Q9D620 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab11fip1Q9D620 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab11fip1Q9D620 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab11fip1Q9D620 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab11fip1Q9D620 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab11fip1Q9D620 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab11fip1Q9D620 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab11fip1Q9D620 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab11fip1Q9D620 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab11fip1Q9D620 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab11fip1Q9D620 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab11fip1Q9D620 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab11fip1Q9D620 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab11fip1Q9D620 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab11fip1Q9D620 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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Rab11fip1Q9D620 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab11fip1Q9D620 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab11fip1Q9D620 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab11fip1Q9D620 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab11fip1Q9D620 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab11fip1Q9D620 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab11fip1Q9D620 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab11fip1Q9D620 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab11fip1Q9D620 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab11fip1Q9D620 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab11fip1Q9D620 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab11fip1Q9D620 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab11fip1Q9D620 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab11fip1Q9D620 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab11fip1Q9D620 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab11fip1Q9D620 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab11fip1Q9D620 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab11fip1Q9D620 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab11fip1Q9D620 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab11fip1Q9D620 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab11fip1Q9D620 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab11fip1Q9D620 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab11fip1Q9D620 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab11fip1Q9D620 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab11fip1Q9D620 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab11fip1Q9D620 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab11fip1Q9D620 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab11fip1Q9D620 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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Rab11fip1Q9D620 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab11fip1Q9D620 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab11fip1Q9D620 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab11fip1Q9D620 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab11fip1Q9D620 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
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